Gedung UPTD Laboratorium Kesehatan Daerah Kota Samarinda terdiri dari 4 lantai, dengan rincian;

1. Lantai 1 terdiri dari:

-basement (lahan parkir) yang dapat menampung banyak motor dan mobil

-Ruang penerimaan sampel rujukan

-Ruang laundry

1. Lantai 2 terdiri dari:

-Ruang pelayanan dan pendaftaran

-Ruang administrasi teknis

-Ruang pengambilan sampel

-Ruang pelayanan vaksinasi

-Ruang pemeriksaan kesehatan

1. Lantai 3 terdiri dari:

-Ruang Administrasi Tata Usaha

-Ruang Kepala UPTD

-Ruang Pertemuan

-Ruang RT-PCR

-Ruang Immunoserologi

-Ruang Hematologi

-Ruang Kimia Klinik

-Ruang Pengendali Mutu

1. Lantai 4

-Gudang