UPTD Laboratorium Kesehatan Daerah Kota Samarinda merupakan laboratorium milik pemerintah daerah yang berada di bawah naungan Dinas Kesehatan Kota Samarinda. Melalui Keputusan Wali Kota Samarinda Nomor: 441/249/HK-KS/VII/2021 UPTD Labkesda Kota Samarinda telah resmi ditetapkan menjadi Badan Layanan Umum Daerah (BLUD) sejak 1 Januari 2022.